Il Centro viene inizialmente fondato come biblioteca del Sert di Borgo Pinti Firenze nel 1993, successivamente nel 1995 diviene Centro Studi del Dipartimento Dipendenze ubicandosi in via San Salvi 12, Palazzina 27, 50135 Firenze, dove si trova ad oggi. Nel 1999 entra nel Progetto Retecedro della Regione Toscana assumendone il coordinamento, tale progetto prevedeva l'adozione di un catalogo bibliotecario comune da parte dei Centri Studi sulle Dipendenze della Regione Toscana, oltre alla cura di alcuni siti online tematici ed altre iniziative comuni, il progetto è stato finanziato fino al 2011.
Nel 2014 il Cesda sceglie di svolgere il lavoro di catalogazione secondo i canoni del polo SDIAF
